Su desaparicion

Entre los años 1150 y 1200, el Cañon del Chaco quedó prácticamente abandonado y en gran medida vació, hasta que los pastores navajo volvieron a ocuparlo seiscientos años mas tarde.

Su desaparicion es un misterio, al respecto que se estima o se cree que por la sequía de 1670 probablemente muchas personas murieron de hambre, otras se mataron entre si y los supervivientes huyeron a otras zonas colonizadas en el sudoeste de Estados Unidos. Uno de los asentamientos en la que los supervivientes del Chaco consiguieron huir se encuentran: algunos pueblos de la zona de los actuales pueblos zuñi, en las cuales se encontraron estancias construidas de un modo similar a la viviendas del Cañon del Chaco.
Los anasazi abandonaron el valle en una época en la que podrían haber obtenido cosecha de maíz en poca cantidad pero suficientes para mantener a un tercio de la población máxima que llagó a albergar, aproximadamente unos 400 habitantes de los 1070. Otro interrogante es por que estos últimos 400 anasazi no se quedaron y decidieron huir. quizá en el año 1300 el valle se había deteriorado demasiado para poder mantener a los seres humanos ademas de haberse reducido el potencial agrícola. la fertilidad del suelo se habría agotado, los antiguos bosques habrían talados y no quedaba ninguna madera útil para la construcción y para la leña, etc.
Para los anasazi, la deforestacion fue un problema grave ya que necesitaban de arboles para abastecerse de vigas con las que construir los techos de sus viviendas.
Los anasazi sobrevivieron en el Cañon del chaco durante aproximadamente 600 años.

Una explicación para justificar la desaparición de los anasazi apunta al canibalismo.